El osteosarcoma es un tipo de cáncer óseo agresivo que afecta a niños y adultos jóvenes de entre 10 y 20 años. El equipo de investigación del Laboratorio Europeo de Biología Molecular de Reino Unido ha logrado resolver el misterio sobre el reordenamiento genómico que provoca el desarrollo de estos tumores.
Se trata de un cáncer que puede requerir cirugía o amputación para su tratamiento y que tiene potencial de propagarse a otros órganos.
Este trabajo, publicado en 'Cell', es una colaboración entre el Instituto Europeo de Bioinformática del EMB, el University College de Londres (UCL) , el Royal National Orthopaedic Hospital y el laboratorio de I+D de Genomics England, todos en Reino Unido.
Para realizar la investigación analizaron la colección de datos del genoma completo en pacientes que tenían osteosarcoma e identificaron un nuevo mecanismo de mutación, la cromotripsis por pérdida-translocación-amplificación (LTA), que está presente en el 50% de los casos. Esto explica porqué es un tumor tan agresivo e tiene inestabilidad genómica.
Con el estudio también han presentado un biomarcador pronóstico que podría usarse para anticipar la enfermedad. La pérdida de heterocigosidad (LOH) en grandes cantidades predice una menor probabilidad de supervivencia.
Isidro Cortes-Ciriano, jefe de grupo en EMBL-EBI y coautor principal del estudio, ha explicado que "al estudiar las anomalías genéticas en diferentes regiones de cada tumor y utilizar nuevas tecnologías que nos permiten leer grandes tramos de ADN, hemos podido entender cómo se rompen y reorganizan los cromosomas".
A través de la secuenciación de lectura larga han podido analizar diferentes regiones de cada tumor de osteosarcoma, algo crucial para identificar el mecanismo de cromotripsis de LTA y averiguar que los cromosomas reorganizados siguen adquiriendo anomalías según avanza el cáncer.
Por otro lado, también analizaron datos de secuenciación del genoma completo de más de 5.300 tumores de distintos tipos de cáncer e identificaron que las anomalías surgen porque los cromosomas afectados son muy inestables.
En este estudio se han basado en el Proyecto 100.000 Genomas, un estudio pionero dirigido por Genomics England y NHS England. Con el descubrieron la prevalencia de cromotripsis LTA en aproximadamente el 50% de los osteosarcomas de alto grado.
Greg Elgar, director de I+D de secuenciación en Genomics England, ha explicado que "la investigación demuestra lo que se puede lograr cuando el ámbito académico, la práctica clínica y el NHS trabajan juntos y combinan esfuerzos de investigación y desarrollo en estas tres áreas".
