La Abogacía del Estado ha presentado una querella por presunta prevaricación contra el juez Peinado, instructor del caso Begoña, quien también ha tratado de tomar declaración al presidente del Gobierno, Pedro Sánchez, aunque se ha negado a declarar. El periodista Alfonso Pérez Medina destaca que "no es Pedro Sánchez a título personal" quien está denunciando "sino que es una institución del Estado, un poder del Estado, frente a otro".

Según explica el periodista, esta querella "lo que viene a decir es que es un poder del Estado, el poder Judicial, el que está alterando innecesariamente la labor que realiza otro poder del Estado, el poder Ejecutivo". Por eso mismo, "la Abogacía del Estado, en nombre del Gobierno, presenta esta querella".

Asimismo, Pérez Medina señala que al igual que ha ocurrido en otros procedimientos, como el de Antonio Costa o el de Lula da Silva, "lo que se busca es que con decisiones judiciales, tener una relevancia pública, una relevancia electoral, una influencia en el desarrollo de los acontecimientos". Ya que como ha recordado el periodista, "toda esta instrucción se produce en vísperas de las elecciones europeas".